Aperçu
La technologie Elastic High Performance Computing (HPC) est désormais accessible aux chercheurs du monde entier pour accélérer la découverte de médicaments et de vaccins ainsi que les efforts de développement de la santé publique face à la pandémie mondiale de la nouvelle maladie à coronavirus (COVID-19).
À ce jour, cette technologie a accompagné une vingtaine de groupes de recherche dans leurs travaux sur la COVID-19, avec des solutions telles que la conception de médicaments assistée par IA, le diagnostic par imagerie CT et la métatranscriptomique bioinformatique. Le système intelligent de diagnostic CT de la pneumonie liée à la COVID-19, développé par l'Université Tsinghua, est capable d'établir un diagnostic pour les cas suspects en 10 secondes. Pour l'Université Sun Yat-sen, elle a multiplié par 5 le taux de transfert des données bioinformatiques et amélioré de 25 % les performances d'assemblage génomique. La technologie Jingtai a réduit le temps de criblage virtuel de médicaments de plus d'un mois à une semaine, accélérant considérablement le processus de test in vitro.
La technologie Elastic High Performance Computing (E-HPC) offre une plateforme HPC+IA destinée aux chercheurs travaillant sur des applications et des solutions de sciences de la vie dans le cloud, en particulier pour la conception de médicaments par calcul (CDDD) et la conception de médicaments assistée par IA (AIDDD) contre la COVID-19. Elle permet aux chercheurs de se concentrer exclusivement sur la recherche.
Cas d'utilisation
Ces trois cas d'utilisation, proposés par des chercheurs du monde entier, exploitent la technologie Elastic HPC directement dans la recherche en sciences de la vie sur la COVID-19, ou permettent d'accéder à la plateforme de recherche du Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI). La plateforme de recherche et développement de médicaments du GHDDI a été mise en place avec succès et a accompagné plus de 100 chercheurs externes.
Cette technologie
Pour accélérer le processus de recherche, la technologie E-HPC fournit des instances hautes performances grâce au réseau RoCE et au GPGPU, ainsi que des logiciels optimisés tels que Gromacs et NAMD. Les chercheurs en biopharmacie peuvent se connecter au cluster via SSH et mener leurs recherches directement. Étant donné que cette plateforme E-HPC est ouverte, les partenaires biopharmaceutiques de ce programme peuvent y intégrer leurs solutions et mutualiser leurs ressources de calcul afin de les mettre à la disposition de leurs partenaires. Par exemple, le Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI) a mis en place la plateforme « Système fédéré de données et d'IA pour la découverte collaborative de médicaments ». Les chercheurs des partenaires du GHDDI peuvent également utiliser le cluster E-HPC via la plateforme GHDDI.
Produits associés
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Une plateforme cloud HPCaaS fournissant un service de calcul public haute performance tout-en-un.
Cette technologie
La technologie Elastic HPC fournit des clusters de calcul parallèle avec accélération du transfert de données pour prendre en charge le processus d'analyse métatranscriptomique en bioinformatique. Le service E-HPC assure le transfert à distance des données génétiques, la décompression, l'assemblage, l'alignement et le mappage par processus de calcul.
Grâce à l'accélération du transfert de données interrégional, les données de la base de données publique peuvent être rapidement transférées vers les clusters de calcul locaux des clients.
Produits associés
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Une plateforme cloud HPCaaS fournissant un service de calcul public haute performance tout-en-un.
Cette technologie
Le Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI) a développé un système de découverte de médicaments par calcul haute performance, spécialement conçu pour la COVID-19 grâce à la technologie Elastic HPC.
Le GHDDI et ses partenaires ont déjà mené des travaux de calcul exhaustifs pour la découverte de médicaments contre la COVID-19. Le GHDDI invite désormais les communautés scientifiques du monde entier à bâtir sur ces travaux afin de maximiser l'efficacité et de réduire les efforts redondants.
Le système de calcul cloud pour la découverte de médicaments contre la COVID-19 offre :
⢠Répertoires de données COVID-19 du GHDDI : base de données pharmacologiques antivirales, données de structure 3D des cibles du SARS-CoV-2 et des cibles hôtes associées, et bibliothèques virtuelles de composés couvrant des millions de composés disponibles dans le commerce.
⢠Systèmes de calcul : modèles de criblage de médicaments par IA entraînés et environnement de deep learning entièrement configuré basé sur Pytorch, système de criblage virtuel conventionnel utilisant des outils tels que GOLD et AutoDock avec capacité de traitement parallélisé, et outils de calcul biophysique tels qu'Amber et NAMD pour l'étude des mécanismes ciblés et le calcul de l'énergie libre pour le raffinement du docking.
Produits associés
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Une plateforme cloud HPCaaS fournissant un service de calcul public haute performance tout-en-un.
Gratuit pour les organismes de recherche publics
Les plateformes gratuites de calcul et d'IA pour la recherche, l'analyse et la lutte contre la COVID-19 (le « Programme ») visent à accompagner les organismes de recherche publics du monde entier dans la recherche, l'analyse et la prévention de la COVID-19. Vous pouvez soumettre le résumé et la description de votre projet de recherche à wanqing.hwq@alibaba-inc.com. Nous examinerons chaque soumission pour évaluer sa faisabilité technique et contacterons les candidats éligibles pour leur communiquer les détails et les prochaines étapes du processus. Une fois la soumission acceptée, le candidat recevra un certain montant de coupons en fonction du projet, valables pendant 3 mois. Ces coupons sont utilisables pour tous les produits Alibaba Cloud, y compris HPC, ECS et GPU, à l'exclusion des produits du Marketplace et des produits tiers.
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