Scénario

Ce modèle présente les bonnes pratiques d'utilisation de la solution WDL-Canu fournie par Batch Compute pour réaliser l'assemblage de génomes de troisième génération.

Procédures

Voici les instructions de déploiement pour la solution - Utiliser Batch Compute pour le séquençage et l'assemblage de génomes de troisième génération :

1. Check the alibaba cloud account permission, should include these services ECS, VPC, NAS, and BCS, RAM, and OSS.

2. Cliquez sur le bouton/lien Créer un stack, puis suivez l'assistant pour spécifier les paramètres.

3. Une fois le stack créé, la tâche d'assemblage Canu est soumise. Si nécessaire, les informations ECS sont consultées via la page de sortie du stack, et les commandes (cd /root/tmp && ./start_canu_task.sh) sont exécutées dans la console ECS ou en se connectant à l'instance ECS via SSH.

Consulter les bonnes pratiques pour plus de détails

Ressources

Diagramme d'architecture

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