Ringkasan
Teknologi Elastic High Performance Computing (HPC) kini tersedia bagi peneliti di seluruh dunia untuk mempercepat penemuan obat dan vaksin serta upaya pengembangan kesehatan masyarakat dalam menghadapi wabah global penyakit coronavirus baru (COVID-19).
Hingga saat ini, teknologi ini telah mendukung sekitar 20 grup riset yang melaksanakan riset COVID-19 dengan solusi seperti desain obat berbasis AI, diagnostik pencitraan CT, dan metatranskriptomik bioinformatika. Sistem diagnostik CT cerdas untuk pneumonia COVID-19 yang dikembangkan oleh Tsinghua University mampu menyelesaikan diagnosis kasus suspek dalam 10 detik. Laju transfer dataset bioinformatika dipercepat 5 kali lipat, dan performa assembli gen dipercepat 25% untuk Sun Yat-sen University. Teknologi Jingtai telah mempercepat waktu skrining virtual obat dari lebih dari satu bulan menjadi satu minggu, yang sangat mempercepat proses uji in vitro obat.
Teknologi Elastic High Performance Computing (E-HPC) menghadirkan platform HPC+AI untuk peneliti aplikasi dan solusi ilmu kehidupan yang berjalan di cloud, khususnya untuk Computational-Driven-Drug-Design (CDDD) dan AI-driven-Drug-Design (AIDDD) untuk COVID-19, serta membantu peneliti fokus sepenuhnya pada riset.
Kasus Penggunaan
Tiga kasus penggunaan dari peneliti global ini memanfaatkan teknologi Elastic HPC secara langsung dalam penelitian ilmu kehidupan untuk COVID-19, atau mendapatkan akses ke platform penelitian melalui Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI). Platform penelitian dan pengembangan obat GHDDI telah berhasil didirikan dan menanggapi lebih dari 100 peneliti eksternal.
Teknologi Ini
Untuk mempercepat proses penelitian, teknologi E-HPC menyediakan instans berkinerja tinggi dengan jaringan RoCE dan GPGPU, serta paket perangkat lunak yang disetel untuk performa, seperti Gromacs dan NAMD. Peneliti biofarmasi dapat login ke kluster menggunakan SSH dan melakukan penelitian secara langsung.
Karena E-HPC ini adalah platform terbuka, mitra biofarmasi dari program ini dapat mengintegrasikan solusi mereka di kluster E-HPC, serta menggabungkan solusi dan resource komputasi menjadi satu untuk dibuka bagi mitra mereka. Misalnya, Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI) telah mendirikan platform "Sistem Data dan AI Terfederasi untuk Penemuan Obat Kolaboratif". Peneliti dari mitra GHDDI juga dapat menggunakan kluster E-HPC melalui platform GHDDI.
Produk Terkait
-
Platform cloud HPCaaS yang menyediakan layanan komputasi publik berkinerja tinggi all-in-one.
Teknologi Ini
Teknologi Elastic HPC menyediakan kluster komputasi paralel dengan akselerasi transfer data untuk mendukung proses analisis meta-transkriptomik bioinformatika. Layanan E-HPC mengimplementasikan transfer data genetik jarak jauh, dekompresi, perakitan, penjajaran, dan pemetaan melalui proses komputasi.
Dengan memanfaatkan fitur akselerasi transfer data lintas region, data dari database publik dapat ditransfer dengan cepat ke kluster komputasi lokal pelanggan.
Produk Terkait
-
Platform cloud HPCaaS yang menyediakan layanan komputasi publik berkinerja tinggi all-in-one.
Teknologi Ini
Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI) telah membangun sistem penemuan obat komputasional berkinerja tinggi yang dirancang khusus untuk COVID-19 dengan teknologi Elastic HPC.
Bersama para mitra, GHDDI telah melakukan upaya komputasional menyeluruh untuk penemuan obat COVID-19. GHDDI kini mengundang komunitas ilmiah di seluruh dunia untuk melanjutkan upaya sebelumnya secara bersama guna memaksimalkan efisiensi dan meminimalkan pekerjaan yang berulang.
Sistem Komputasi Cloud Penemuan Obat COVID-19 menawarkan:
• Repositori Data COVID-19 GHDDI: Database farmakologi antivirus, data struktur 3D untuk target SARS-CoV-2 dan target inang terkait, serta library senyawa virtual yang mencakup jutaan senyawa yang tersedia secara komersial.
• Sistem Komputasional: Model skrining obat AI yang telah dilatih dan lingkungan deep learning yang dikonfigurasi sepenuhnya berdasarkan PyTorch, sistem skrining virtual konvensional menggunakan tool seperti GOLD, AutoDock dengan kemampuan pemrosesan terparalel, serta tool komputasional biofisika seperti Amber dan NAMD untuk studi mekanisme target dan komputasi energi bebas untuk penyempurnaan docking.
Produk Terkait
-
Platform cloud HPCaaS yang menyediakan layanan komputasi publik berkinerja tinggi all-in-one.
Gratis untuk Institusi Riset Publik
Platform Komputasi dan AI Gratis untuk Membantu Riset, Analisis, dan Penanganan COVID-19 ("Program") bertujuan mendukung institusi riset publik di seluruh dunia dalam analisis riset dan pencegahan COVID-19. Anda dapat mengirimkan ringkasan dan deskripsi proyek riset Anda ke wanqing.hwq@alibaba-inc.com. Semua pengajuan akan ditinjau dari segi kelayakan teknis, dan pelamar yang memenuhi syarat akan dihubungi untuk detail lebih lanjut serta langkah berikutnya. Jika pengajuan berhasil, pelamar akan mendapatkan kupon dengan nilai tertentu sesuai proyek, yang berlaku selama 3 bulan. Kupon dapat digunakan untuk semua produk Alibaba Cloud, termasuk HPC, ECS, dan GPU, kecuali produk marketplace dan produk pihak ketiga.
Daftar SekarangResource Terkait
Whitepaper
Alibaba Cloud Membantu Melawan COVID-19 melalui Teknologi
Menyoroti teknologi cloud, program, dan inisiatif Alibaba Cloud yang membantu melawan ancaman COVID-19.
Whitepaper
Teknologi Elastic High Performance Computing
Menjelaskan bagaimana teknologi E-HPC dan AI Alibaba Cloud dapat membantu lembaga penelitian ilmiah.
Webinar
HPC Alibaba Cloud Memberdayakan Penemuan Obat Berbasis Komputasi untuk Melawan COVID-19
Menjelajahi bagaimana HPC Alibaba Cloud mendukung peneliti dan rumah sakit untuk menyiapkan platform penemuan obat berbasis komputasi dan sistem analitik pencitraan CT di cloud.