CLI を使用してジョブを送信する - Elastic High Performance Computing

エラスティックハイパフォーマンスコンピューティング（E-HPC）は、PBS、SLURM、SGE などのスケジューラをサポートしています。このトピックでは、CLI を使用してスケジューラに基づいてジョブを送信する方法について説明します。

前提条件

ユーザーが作成されていること。詳細については、「ユーザーを管理する」をご参照ください。
ユーザーは、クラスタへのログオン、ソフトウェアのコンパイル、ジョブの送信に使用されます。この例では、次の設定が使用されます。
- ユーザー名: testuser
- ユーザーグループ: sudo 権限グループ
重要
root ユーザーを使用してジョブを送信しないことをお勧めします。これにより、ジョブスクリプトの不適切な操作が原因でクラスタデータが破損するのを防ぎます。
関連ディレクトリにデータファイルと実行プログラムファイルを準備します。
この例では、次のパスが使用されます。
```
$HOME/test.py           // 実行プログラムファイル
$HOME/test.data         // ジョブデータファイル
```
ジョブ実行コマンドの例:
```
test.py -i test.data
```

クラスタに接続する

E-HPC クライアントまたは E-HPC コンソールを使用して、クラスタに接続します。この例では、ユーザー名は testuser です。クラスタに接続すると、自動的に /home/testuser にログオンします。

E-HPC クライアントを使用してクラスタにログオンする
クラスタのスケジューラは PBS である必要があります。 E-HPC クライアントをダウンロードしてインストールし、クライアントに必要な環境をデプロイしていることを確認します。詳細については、「E-HPC クライアントの環境をデプロイする」をご参照ください。
1. E-HPC クライアントを起動してログオンします。
2. 左側のナビゲーションペインで、[セッション管理] をクリックします。
3. [セッション管理] ページの右上隅にある [ターミナル] をクリックして、ターミナルウィンドウを開きます。
E-HPC コンソールを使用してクラスタにログオンする
1. E-HPC コンソールにログオンします。
2. トップナビゲーションバーの左上隅で、リージョンを選択します。
3. 左側のナビゲーションペインで、[クラスタ] をクリックします。
4. [クラスタ] ページで、クラスタを見つけて [接続] をクリックします。
5. [接続] パネルで、ユーザー名とパスワードを入力し、[SSH 経由で接続] をクリックします。

ジョブを送信する

スケジューラのタイプに基づいてジョブスクリプトファイルを作成し、次のジョブスクリプトをファイルにコピーしてから、ジョブを送信します。例:

説明

自動スケーリングシナリオでは、E-HPC はメモリベースのスケーリングをサポートしていません。ジョブを送信するときに、必要な vCPU の数を指定することをお勧めします。

PBS

jobscript.pbs という名前のジョブスクリプトファイルを作成します。

vim jobscript.pbs

次のセクションでは、jobscript.pbs ファイルの内容の例を示します。 PBS CLI の詳細については、PBS 公式 Web サイトにアクセスしてください。

#!/bin/sh
# PBS -l ncpus=4,mem=1gb   // ジョブの実行に必要なコンピューティングリソース。
# PBS -l walltime=00:10:00   // ジョブの推定期間。
# PBS -o test_pbs.log              // stdout の出力ファイル。
# PBS -j oe                              // stderr と stdout を上記の出力ファイルにリダイレクトします。
cd $HOME
test.py -i test.data

ジョブを送信します。
```
qsub jobscript.pbs
```

SLURM

jobscript.slurm という名前のジョブスクリプトファイルを作成します。

vim jobscript.slurm

次のセクションでは、jobscript.slurm ファイルの内容の例を示します。 SLURM CLI の詳細については、SLURM 公式 Web サイトにアクセスしてください。

#!/bin/sh
# SBATCH --job-name=slurm-quickstart // ジョブ名。
# SBATCH --output=test_slurm.log           // stdout の出力ファイル。
# SBATCH --nodes=1                                 // ノード数。
# SBATCH --ntasks=1                                 // タスク数。
# SBATCH --cpus-per-task=1                     // 各タスクに必要な vCPU の数。
# SBATCH --time=00:10:00 // ジョブの推定期間。
# SBATCH --mem-per-cpu=1024              // 各 vCPU に割り当てられるメモリ。
cd $HOME
test.py test.data

ジョブを送信します。
```
sbatch jobscript.slurm
```

SGE

jobscript.sh という名前のジョブスクリプトファイルを作成します。
```
vim jobscript.sh
```
次の例は、jobscript.sh の内容を示しています。 SGE CLI の詳細については、SGE 公式 Web サイトにアクセスしてください。
```
#!/bin/bash
#$ -cwd // 実行パスを現在のパスとして指定します。
#$ -N test1 // ジョブ名。
#$ -q all.q // ジョブのキュー。
#$ -pe smp 2 // ジョブの実行に必要な vCPU の数。
#$ -l vf=1g // ジョブの実行に必要なメモリサイズ。
#$ -o /home/testuser // stdout ログパス。
#$ -e /home/testuser // エラーログパス。
cd $HOME
test.py test.data
```
重要
E-HPC クラスタは、自動スケーリング中にジョブで必要な vCPU の数に基づいて ECS インスタンスタイプを選択します。 SGE ジョブスクリプトを記述する場合は、-pe smp を使用してジョブで必要な vCPU の数を指定する必要があります。
ジョブを送信します。
```
qsub -V jobscript.sh
```