Elastic High Performance Computing:ジョブのパフォーマンスと結果を表示する

前提条件

ジョブが作成され、完了していること。詳細については、「ジョブの作成と送信」をご参照ください。

手順

1. E-HPC コンソール にログオンします。

2. 上部のナビゲーションバーで、リージョンを選択します。

3. 左側のナビゲーションウィンドウで、 を選択します。

4. [詳細] ページの右側にある [ジョブ] をクリックして、ジョブの詳細を表示します。

5. ジョブのパフォーマンスを表示します。

   1. 左側のナビゲーションウィンドウで、[E-HPC チューン] を選択します。

   2. [クラスタビュー] ページで、gromacs-test を見つけ、[操作] 列の [ノード] をクリックします。

   3. ジョブとノードを選択します。メトリック構成を完了して、ノードのパフォーマンスを表示します。

      

   4. [ProcView] タブをクリックすると、現在の時点で CPU 使用率が最も高い上位 5 つのプロセスの詳細が表示されます。

      

   5. プロファイルするノード プロセスをクリックします。プロファイルの期間と頻度を設定し、GROMACS ジョブのリアルタイム プロファイリングを開始して、ホット関数のフレームグラフを取得します。

      

6. VNC を使用してジョブの結果を表示します。

   1. [クラスタ] ページで、gromacs-test を見つけます。[詳細] > [VNC] を選択します。

   2. E-HPC のクラウドデスクトップで、[接続] をクリックします。

   3. [パスワードの入力] ダイアログボックスで、パスワードを入力し、[OK] をクリックします。

   4. クラウドデスクトップの [仮想化サービス] ダイアログボックスで、[アプリケーション] > [システムツール] > [ターミナル] を選択します。

   5. クラウドデスクトップの [ターミナル] ダイアログボックスで /opt/vmd/1.9.3/vmd を実行して、Visual Molecular Dynamics（VMD）を開きます。

   6. 分子構造および軌道のファイルを読み込んで VMD でシミュレーション効果を表示します。