Información general
La tecnología Elastic High Performance Computing (HPC) ahora está disponible para investigadores de todo el mundo para acelerar el descubrimiento de fármacos y vacunas y los esfuerzos de desarrollo de la salud pública contra el brote mundial de la nueva enfermedad por coronavirus (COVID-19).
Hasta ahora, esta tecnología ha apoyado a alrededor de 20 grupos de investigación que implementan su investigación sobre el COVID-19 con soluciones como el diseño de fármacos impulsados por IA, el diagnóstico por imágenes de TC y la metatranscriptómica bioinformática. El sistema inteligente de diagnóstico por TC de la neumonía en enfermos de COVID-19 desarrollado por la Universidad de Tsinghua puede completar el diagnóstico del caso sospechoso en 10 segundos. La tasa de transferencia de conjuntos de datos bioinformáticos se acelera en 5 veces y el rendimiento del ensamblaje de genes se acelera en un 25% para la Universidad Sun Yat-sen. La tecnología Jingtai aceleró el tiempo de detección virtual de fármacos de más de un mes a una semana, lo que aceleró en gran medida el proceso de prueba in vitro de fármacos.
La tecnología Elastic-High Performance Computing (E-HPC) presenta una plataforma HPC + IA para investigadores en aplicaciones y soluciones para las ciencias de la vida que se ejecutan en la nube, especialmente para el diseño de fármacos basados en computación (CDDD) diseño de fármacos con la tecnología de la IA (AIDDD) para el COVID-19, y ayuda a los investigadores a centrarse únicamente en la investigación
Casos de uso
Estos tres casos de uso de investigadores globales usan la tecnología Elastic-HPC directamente en la investigación de ciencias de la vida sobre COVID-19 u obtienen acceso a la plataforma de investigación en el Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI). La plataforma de investigación y desarrollo de medicamentos del GHDDI se estableció con éxito y respondió a más de 100 investigadores externos.
Esta tecnología
Para acelerar el proceso de investigación, la tecnología E-HPC proporciona instancias de alto rendimiento con la red RoCE y GPGPU, y paquetes de software ajustados al rendimiento, como Gromacs y NAMD. Los investigadores biofarmacéuticos podrían iniciar sesión en el clúster usando SSH y realizar las investigaciones directamente.
Debido a que este E-HPC es una plataforma abierta, los socios biofarmacéuticos de este programa pueden integrar sus soluciones en el clúster E-HPC y combinar las soluciones y los recursos informáticos en uno para abrirlos a sus socios. Por ejemplo, el Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI) estableció la plataforma "Datos federados y sistema IA para el descubrimiento colaborativo de fármacos". Los investigadores de los socios de GHDDI también pueden usar clústeres E-HPC a través de la plataforma del GHDDI.
Productos relacionados
-
Plataforma de nube HPCaaS que proporciona un servicio de cálculo público de alto rendimiento todo en uno.
Esta tecnología
La tecnología Elastic-HPC proporciona clústeres de cálculo paralelo con aceleración de transferencia de datos para respaldar el proceso de análisis de meta-transcriptómica bioinformática. El servicio E-HPC implementa la transferencia remota de datos genéticos, la descompresión, el ensamblaje, la alineación y el mapeo a través del proceso de cálculo.
Al aprovechar la característica de aceleración de transferencia de datos entre regiones, los datos de la base de datos pública se pueden transferir rápidamente a los clústeres de cálculo locales de los clientes.
Productos relacionados
-
Plataforma de nube HPCaaS que proporciona un servicio de cálculo público de alto rendimiento todo en uno.
Esta tecnología
El Global Health Drug Discovery Institute (GHDDI) construyó un sistema informáticode descubrimiento de fármacos de alto rendimiento diseñado específicamente para el COVID-19 con tecnología Elastic-HPC.
El GHDDI y sus socios ya realizaron esfuerzos informáticos integrales para el descubrimiento de fármacos para el COVID-19. El GHDDI ahora invita a las comunidades científicas de todo el mundo a trabajar juntos en los esfuerzos anteriores para maximizar la eficiencia y minimizar los esfuerzos redundantes.
El sistema informático en la nube de descubrimiento de fármacos para el COVID-19 ofrece:
• Repositorios de datos del GHDDI sobre el COVID-19: base de datos de farmacología antiviral, datos de estructura 3D para objetivos de SARS-CoV-2 y objetivos huésped relacionados, y bibliotecas de compuestos virtuales que cubren millones de compuestos disponibles comercialmente.
• Sistemas informáticos: modelos entrenados de detección de drogas de IA y un entorno de aprendizaje profundo totalmente configurado basado en Pytorch, sistema de detección virtual convencional que usa herramientas como GOLD, AutoDock con capacidad de procesamiento paralelizada y herramientas informáticas de biofísica como Amber, NAMD para el estudio del mecanismo de destino e informática de energía libre para el perfeccionamiento de la acoplamiento.
Productos relacionados
-
Plataforma de nube HPCaaS que proporciona un servicio de cálculo público de alto rendimiento todo en uno.
Gratis para las instituciones públicas de investigación
Las plataformas computacionales y de IA gratuitas para ayudar a investigar, analizar y combatir el COVID-19 ("Programa") están destinadas a apoyar a las instituciones públicas de investigación de todo el mundo para el análisis de la investigación y la prevención del COVID-19. Puede enviar el resumen y la descripción de su proyecto de investigación a wanqing.hwq@alibaba-inc.com. Se revisará la viabilidad técnica de todas las presentaciones y se contactará a los solicitantes elegibles para obtener más detalles e informarles los próximos pasos del proceso. Una vez que la presentación sea exitosa, el solicitante recibirá una cierta cantidad de cupones en función del proyecto, que son válidos por 3 meses. El cupón se puede usar para todos los productos en la nube de Alibaba, incluidos HPC, ECS y GPU, excluyendo los productos del mercado y los productos de terceros.
Solicitar ahoraRecursos relacionados
Documento técnico
Alibaba Cloud ayuda a combatir el COVID-19 a través de la tecnología
Destaca las tecnologías, programas e iniciativas en la nube de Alibaba Cloud que ayudan a luchar contra la amenaza del COVID-19.
Documento técnico
Tecnología Elastic-High Performance Computing
Explica cómo las tecnologías E-HPC e IA de Alibaba Cloud pueden ayudar a las instituciones de investigación científica.
Seminario web
Alibaba Cloud HPC habilita el descubrimiento computacional de fármacos para luchar contra el COVID-19
Explora cómo HPC de Alibaba Cloud ayuda a los investigadores y hospitales a configurar su plataforma computacional de descubrimiento de fármacos y su sistema analítico de imágenes de TC en la nube.